MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_lp28-5

Total Repeats: 541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017415	TAT	2	6	112	117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828012
2	NC_017415	CCT	2	6	161	166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387828012
3	NC_017415	CTT	2	6	193	198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387828012
4	NC_017415	CTC	2	6	230	235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387828012
5	NC_017415	AACT	2	8	253	260	50 %	25 %	0 %	25 %	387828012
6	NC_017415	TAT	2	6	274	279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828012
7	NC_017415	T	6	6	291	296	0 %	100 %	0 %	0 %	387828012
8	NC_017415	ATA	2	6	300	305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828012
9	NC_017415	AAC	2	6	306	311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828012
10	NC_017415	AGAA	2	8	348	355	75 %	0 %	25 %	0 %	387828012
11	NC_017415	TTA	2	6	357	362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828012
12	NC_017415	CTC	2	6	368	373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387828012
13	NC_017415	TCAC	2	8	381	388	25 %	25 %	0 %	50 %	387828012
14	NC_017415	TAC	2	6	395	400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387828012
15	NC_017415	T	6	6	438	443	0 %	100 %	0 %	0 %	387828012
16	NC_017415	ACT	2	6	530	535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387828012
17	NC_017415	A	7	7	548	554	100 %	0 %	0 %	0 %	387828012
18	NC_017415	AAC	2	6	589	594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828012
19	NC_017415	TAT	2	6	611	616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828012
20	NC_017415	CCAA	2	8	624	631	50 %	0 %	0 %	50 %	387828012
21	NC_017415	AT	3	6	639	644	50 %	50 %	0 %	0 %	387828012
22	NC_017415	T	6	6	1384	1389	0 %	100 %	0 %	0 %	387828013
23	NC_017415	TTC	2	6	1439	1444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387828013
24	NC_017415	ATTT	2	8	1463	1470	25 %	75 %	0 %	0 %	387828013
25	NC_017415	TTTCT	2	10	1475	1484	0 %	80 %	0 %	20 %	387828013
26	NC_017415	TTA	2	6	1554	1559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828013
27	NC_017415	TAT	2	6	1564	1569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828013
28	NC_017415	TAT	2	6	1586	1591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828013
29	NC_017415	ATT	2	6	1658	1663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828013
30	NC_017415	ATT	2	6	1757	1762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828013
31	NC_017415	T	7	7	1823	1829	0 %	100 %	0 %	0 %	387828013
32	NC_017415	TCAA	2	8	1833	1840	50 %	25 %	0 %	25 %	387828013
33	NC_017415	TCA	2	6	1875	1880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387828013
34	NC_017415	TAATA	2	10	1921	1930	60 %	40 %	0 %	0 %	387828013
35	NC_017415	CTTT	2	8	1941	1948	0 %	75 %	0 %	25 %	387828013
36	NC_017415	T	8	8	1946	1953	0 %	100 %	0 %	0 %	387828013
37	NC_017415	TGA	2	6	1980	1985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387828013
38	NC_017415	CAA	2	6	2029	2034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828013
39	NC_017415	A	7	7	2033	2039	100 %	0 %	0 %	0 %	387828013
40	NC_017415	TCT	2	6	2055	2060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387828013
41	NC_017415	T	9	9	2065	2073	0 %	100 %	0 %	0 %	387828013
42	NC_017415	TTC	2	6	2132	2137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387828013
43	NC_017415	TCT	2	6	2174	2179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387828013
44	NC_017415	TAG	2	6	2183	2188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387828013
45	NC_017415	CT	3	6	2189	2194	0 %	50 %	0 %	50 %	387828013
46	NC_017415	TTCTT	2	10	2195	2204	0 %	80 %	0 %	20 %	387828013
47	NC_017415	CT	3	6	2213	2218	0 %	50 %	0 %	50 %	387828013
48	NC_017415	TTC	2	6	2219	2224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387828013
49	NC_017415	T	9	9	2234	2242	0 %	100 %	0 %	0 %	387828013
50	NC_017415	ATT	2	6	2243	2248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828013
51	NC_017415	ATC	2	6	2261	2266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387828013
52	NC_017415	CTA	2	6	2284	2289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387828013
53	NC_017415	ATTT	2	8	2293	2300	25 %	75 %	0 %	0 %	387828013
54	NC_017415	TCT	2	6	2306	2311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387828013
55	NC_017415	ATG	2	6	2312	2317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387828013
56	NC_017415	ATA	2	6	2332	2337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828013
57	NC_017415	TAAT	2	8	2338	2345	50 %	50 %	0 %	0 %	387828013
58	NC_017415	A	6	6	2352	2357	100 %	0 %	0 %	0 %	387828013
59	NC_017415	TTAAA	2	10	2359	2368	60 %	40 %	0 %	0 %	387828013
60	NC_017415	AAT	2	6	2390	2395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828013
61	NC_017415	T	7	7	2405	2411	0 %	100 %	0 %	0 %	387828013
62	NC_017415	A	7	7	2412	2418	100 %	0 %	0 %	0 %	387828013
63	NC_017415	A	6	6	3278	3283	100 %	0 %	0 %	0 %	387828014
64	NC_017415	AT	3	6	3300	3305	50 %	50 %	0 %	0 %	387828014
65	NC_017415	TA	4	8	3309	3316	50 %	50 %	0 %	0 %	387828014
66	NC_017415	ATT	2	6	3319	3324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828014
67	NC_017415	T	6	6	3334	3339	0 %	100 %	0 %	0 %	387828014
68	NC_017415	CCA	2	6	3344	3349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387828014
69	NC_017415	CAA	2	6	3364	3369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828014
70	NC_017415	A	7	7	3395	3401	100 %	0 %	0 %	0 %	387828014
71	NC_017415	ATA	2	6	3426	3431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828014
72	NC_017415	AG	3	6	3445	3450	50 %	0 %	50 %	0 %	387828014
73	NC_017415	TAA	2	6	3451	3456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828014
74	NC_017415	AAATA	2	10	3490	3499	80 %	20 %	0 %	0 %	387828014
75	NC_017415	AAG	2	6	3501	3506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828014
76	NC_017415	A	6	6	3574	3579	100 %	0 %	0 %	0 %	387828014
77	NC_017415	T	6	6	3630	3635	0 %	100 %	0 %	0 %	387828014
78	NC_017415	ATTCA	2	10	3641	3650	40 %	40 %	0 %	20 %	387828014
79	NC_017415	AAC	2	6	3692	3697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828014
80	NC_017415	AAG	2	6	3714	3719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828014
81	NC_017415	ATA	2	6	3734	3739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828014
82	NC_017415	A	8	8	3765	3772	100 %	0 %	0 %	0 %	387828014
83	NC_017415	T	6	6	3888	3893	0 %	100 %	0 %	0 %	387828014
84	NC_017415	ATT	2	6	3930	3935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828014
85	NC_017415	A	6	6	3950	3955	100 %	0 %	0 %	0 %	387828014
86	NC_017415	AAAC	2	8	3998	4005	75 %	0 %	0 %	25 %	387828014
87	NC_017415	TAA	2	6	4006	4011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828014
88	NC_017415	TAA	2	6	4051	4056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828014
89	NC_017415	ATTAA	2	10	4061	4070	60 %	40 %	0 %	0 %	387828014
90	NC_017415	AAT	2	6	4220	4225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828015
91	NC_017415	ATT	2	6	4226	4231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828015
92	NC_017415	CAA	2	6	4247	4252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828015
93	NC_017415	TG	3	6	4275	4280	0 %	50 %	50 %	0 %	387828015
94	NC_017415	AAT	2	6	4288	4293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828015
95	NC_017415	TTAA	2	8	4313	4320	50 %	50 %	0 %	0 %	387828015
96	NC_017415	GAA	2	6	4345	4350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828015
97	NC_017415	GAA	3	9	4364	4372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828015
98	NC_017415	A	7	7	4384	4390	100 %	0 %	0 %	0 %	387828015
99	NC_017415	AGA	2	6	4396	4401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828015
100	NC_017415	A	9	9	4406	4414	100 %	0 %	0 %	0 %	387828015
101	NC_017415	ATAAAA	2	12	4449	4460	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387828015
102	NC_017415	AGA	2	6	4463	4468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828015
103	NC_017415	A	6	6	4493	4498	100 %	0 %	0 %	0 %	387828015
104	NC_017415	CTT	2	6	4795	4800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387828016
105	NC_017415	AAT	2	6	4802	4807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828016
106	NC_017415	CTA	2	6	4820	4825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387828016
107	NC_017415	AT	3	6	4834	4839	50 %	50 %	0 %	0 %	387828016
108	NC_017415	T	6	6	4848	4853	0 %	100 %	0 %	0 %	387828016
109	NC_017415	TAA	2	6	4859	4864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828016
110	NC_017415	TCT	2	6	4894	4899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387828016
111	NC_017415	ATT	2	6	4932	4937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828016
112	NC_017415	TTTTCT	2	12	4942	4953	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	387828016
113	NC_017415	TCT	2	6	4999	5004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387828016
114	NC_017415	T	6	6	5083	5088	0 %	100 %	0 %	0 %	387828016
115	NC_017415	TTC	2	6	5127	5132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387828016
116	NC_017415	TCT	2	6	5190	5195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387828016
117	NC_017415	AG	3	6	5215	5220	50 %	0 %	50 %	0 %	387828016
118	NC_017415	ATA	2	6	5233	5238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828016
119	NC_017415	AAT	2	6	5239	5244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828016
120	NC_017415	T	6	6	5244	5249	0 %	100 %	0 %	0 %	387828016
121	NC_017415	ATT	2	6	5371	5376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828016
122	NC_017415	GTT	2	6	5404	5409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387828016
123	NC_017415	T	7	7	5415	5421	0 %	100 %	0 %	0 %	387828016
124	NC_017415	TCT	2	6	5425	5430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387828016
125	NC_017415	A	6	6	5478	5483	100 %	0 %	0 %	0 %	387828016
126	NC_017415	TTGAA	2	10	5486	5495	40 %	40 %	20 %	0 %	387828016
127	NC_017415	A	7	7	5519	5525	100 %	0 %	0 %	0 %	387828016
128	NC_017415	ATT	2	6	5538	5543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828016
129	NC_017415	TCT	2	6	5545	5550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387828016
130	NC_017415	TTC	2	6	5652	5657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387828016
131	NC_017415	TAT	2	6	5673	5678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828016
132	NC_017415	T	6	6	5755	5760	0 %	100 %	0 %	0 %	387828016
133	NC_017415	CAC	2	6	5792	5797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387828016
134	NC_017415	T	6	6	5897	5902	0 %	100 %	0 %	0 %	387828016
135	NC_017415	TTA	2	6	6026	6031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828016
136	NC_017415	A	7	7	6060	6066	100 %	0 %	0 %	0 %	387828016
137	NC_017415	ACT	2	6	6081	6086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387828016
138	NC_017415	ATT	2	6	6114	6119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828016
139	NC_017415	ATT	2	6	6123	6128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828016
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